Попались нестандартные FLAC-файлы с битрейтом 96 килогерц и с 24-битными сэмплами. Переделал в 44100-герцовые и 16-битные с помощью трёх команд:
$ flac -d infile.flac -o temp1.wav $ sox temp1.wav -b 16 -r 44100 -t .wav temp2.wav $ flac temp2.wav -o outfile.flac
Решил записать на память - может понадобится в будущем, а голову ломать второй раз не хочется.